巢湖市人民法院前身是巢县人民法院、巢湖市居巢区人民法院，成立于1950年12月，2011年8月区划调整后更名为巢湖市人民法院。现有编制为113人，在编干警105人，院领导为1正3副，党组成员4人，审委会委员17人，员额法官40人。设有政治部、综合办公室、审判管理办公室（研究室）、立案庭（诉讼服务中心）、刑事审判庭、民事审判一庭、民事审判二庭、环境资源审判庭、行政审判庭（综合审判庭）、执行局（执行庭）、司法警察大队11个内设机构；下设柘皋中心法庭、烔炀中心法庭、槐林中心法庭、黄山法庭。

近年来，巢湖法院在市委坚强领导、市人大及其常委会有力监督，市政府、市政协和社会各界有力支持以及上级法院有力指导下，坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，紧紧围绕“让人民群众在每一个司法案件中感受到公平正义”目标，坚持司法为民、公正司法工作主线，充分发挥审判职能作用，忠实履行宪法和法律赋予的职责，各项工作取得新突破。先后获得全国法院司法新闻宣传工作先进单位、全省法院专项工作集体三等功、司法新闻宣传工作先进单位，全省法院涉诉信访事项化解攻坚专项行动先进集体，合肥法院系统“先进法院”称号、合肥市“五一”劳动奖状、廉政文化示范点、第十五届、十六届“文明单位”、卫生先进单位，巢湖市第六、七、八届“文明单位”、双拥创建模范单位、未成年人思想道德建设工作先进单位、信访维稳工作先进单位、维护稳定工作先进集体、防范和处理邪教工作先进集体、“综治信息平台”建设先进集体、“六五”普法“先进集体”、宣传思想文化工作先进集体、巾帼建功先进集体、平安建设先进成员单位等荣誉称号。第六党支部“护天平 守正义”党建品牌先后被评为“合肥市法院优秀党建品牌”“巢湖市市直机关优秀党建品牌”。